Hans Hendriksen
har især forsket i indoeuropæisk fonologi, jf. Untersuchungen über die Bedeutung des Hethitischen für die Laryngaltheorie (1941), verbalsyntaks i pali, jf. Syntax of the Infinite Verb-Forms of Pali (1944), samt nyindoarisk, fx i Himachali Studies, 1-3 (1976-86).